A preocupação com a segurança e saúde dos colaboradores é uma das premissas da Portonave. Profissionais capacitados, equipamentos e materiais de segurança de alta tecnologia são a base da Gestão da Segurança e Saúde do Trabalho. A equipe da Segurança e Medicina é composta por Engenheiro e Técnicos de Segurança, Médicos e Enfermeiros do Trabalho.
Técnicos de Segurança do Trabalho acompanham as atividades portuárias 24 horas por dia de maneira a prestar o suporte necessário aos colaboradores. Todas as atividades operacionais da empresa possuem procedimentos de Segurança do Trabalho, documentados e disseminados para os colaboradores. As atividades consideradas de risco grave e iminente somente são realizadas após a avaliação e autorização da equipe de Segurança do Trabalho.
A Portonave possui um Plano de Controle de Emergências – PCE para os principais cenários acidentais da área portuária. A estrutura do PCE é composta por equipe de brigadistas, de comunicação e de resgate médico, além dos materiais e equipamentos para atendimentos emergenciais. Para todos os cenários acidentais descritos no PCE são realizados exercícios simulados periodicamente de maneira a manter uma equipe adestrada e pronta para o combate emergencial.
A Portonave tem ainda uma viatura de Resgate Médico, operada por profissionais capacitados, para atuar em situações de atendimentos médicos emergenciais. Esta viatura fica disponível na empresa 24 horas por dia.